La Facultad de Medicina de Pécs cuenta con reconocimiento internacional y es una de las instituciones líderes en Hungría. Los programas de Medicina se ofertan en húngaro, alemán e inglés, lo que aporta un ambiente multicultural a la ciudad. La facultad está formada por 23 departamentos teórico-científicos y preclínicos, así como por 24 departamentos clínicos. Todos ellos se basan en los más altos estándares europeos. El edificio principal, que cuenta con una recepción, aulas magnas bien equipadas y modernos laboratorios, es una parte importante de la facultad. Los profesores son doctores jóvenes, investigadores y catedráticos experimentados. De este modo, los estudiantes adquieren todo lo necesario: tanto las técnicas y conocimientos modernos, como los métodos y la experiencia tradicional. En la Clínica de Odontología y en el hospital universitario, se trata a pacientes procedentes de toda Hungría.

Los programas internacionales en inglés se implantaron en 1984, un motivo más por el que la Universidad de Pécs está considerada como una de las pioneras en Europa central. En el año 2004, se introdujo además el programa internacional en alemán.